一是中央儲備糧長期存在、長期運營，托市臨儲糧是2005年以后為調節當期市場啟動的政策性收購。中央儲備糧和托市臨儲糧的糧權都歸中央。

二是中央儲備糧主要儲存在全國346個中儲糧直屬庫；托市臨儲糧采取中儲糧為執行主體、主要靠委托收儲的體制，85%以上儲存在全國1.1萬

個地方糧食企業手中，由中儲糧、地方糧食行政部門、農發行共同對這部分糧食的數量、質量、庫存管理及銷售出庫等負責。

三是中央儲備糧業務實行中央財政對中儲糧定額包干，企業市場運作、自負盈虧；托市臨儲糧實行中央財政兜底，政府定價、國家拍賣銷售。